廈門大學附屬中山醫院前身為廈門中山醫院。1928年，為弘揚孫中山先生"天下為公，造福社會"的精神，由海外華僑和廈門市知名人士發起創辦。1950年由廈門市人民政府接管后，醫院規模迅速擴大，水平不斷提高。1960年床位達300張。1966年"文革"期間曾更名為"白求恩醫院"，1970年被撤并。1981年廈門經濟特區成立后，廈門市政府決定恢復廈門中山醫院，把其作為改善特區投資環境的重點工程遷址重建。新院址占地6.1萬平方米，建筑面積近9萬平方米。1988年7月正式接納病人。1999年廈門大學醫學院成立后，醫院即作為其教學醫院。2001年，經廈門市政府確定作為廈門大學醫學院第一臨床醫院，成為廈門大學的臨床醫學教學單位。2005年9月，經廈門市人民政府、廈門大學同意，并經福建省衛生廳批準，正式更名為廈門大學附屬中山醫院，并保留廈門中山醫院為第二名稱。醫院經過全體職工的艱苦創業，得到快速發展。目前已成為擁有1000張床位，1500余名員工（含高級專家190余人，碩士以上學歷100余名）。年門、急診量達130萬余人次，收住病人2.7萬余人次，成為集醫療、教學、科研、預防保健于一體的三級現代化綜合性醫院。醫院擁有神經內、外科、骨科、肝膽外科、消化內科、心血管內、外科、臨床檢驗中心等市重點學科，并且在急救醫學、老年康復醫學、婦產科、血液內科、呼吸內科、耳鼻喉科、口腔科、皮膚科、整形外科等學科具有較強優勢。擁有國際一流水平的64層螺旋容積CT、1.5T雙梯度超導核磁共振儀、羅茨雙模塊全自動生化分析儀、雙屏板雙C臂血管造影機，以及ECT、DSA、DR、彩色B超、血液透析機、超聲電子內窺鏡等現代化儀器設備。設備總值達2.2億元。醫院與北京、上海、廣州、福州等地三甲醫院及美國、德國、香港等國內外著名醫院建立協作關系，加強院際交流。醫院擁有廈門心臟中心、廈門市臨床檢驗中心、廈門市老年病康復研究所、廈門市消化疾病研究所等醫療科研機構。醫院每年承擔200多名本科生的臨床教學工作。設有《診斷學》、《內科學》、《外科學》、《婦產科學》、《兒科學》等12個教研室。擁有一支由教授、副教授、研究生導師為主要力量的200名教師隊伍。每年完成本科生臨床理論課、見習課約1800學時，并承擔省內外大、中專院校的臨床、檢驗、護理、藥劑等專業的實習任務及臨床醫學研究生的教學及管理工作。每年獲省、市科技進步獎3-4項，省、市、衛生局科研基金課題20余項。每年發表醫學科技論文200余篇，其中有多篇被SCI、MEDLINE源期刊收錄。醫院職工積極開展精神文明建設，秉持"團結、敬業、求實、創新"的醫院精神，堅持"以病人為中心"的宗旨，在醫院改革和管理、精神文明和政治文明建設方面取得可喜成果，連續多年被評為省、市文明單位。2003年度被評為福建省抗擊非典先進集體。2004年榮獲全國衛生系統先進集體、2005年榮獲全國精神文明建設工作先進單位光榮稱號。新世紀給醫院發展帶來新機遇，醫院布局將按照現代醫院管理和"以病人為中心"的總體思路全面調整。建筑面積達5.6萬平方米的住院---醫技樓群將拔地而起，醫院的臨床、教學、科研預防保健水平將躍上新的臺階，一所高水平人性化的綠色三甲醫院將展現在世人面前。